准确率提升10%!西浦研究团队绘制最精准m6A表观转录组地图
“运用传统的序列信息,人类对m
(图片来源:站酷海洛)
该团队对m
RNA修饰是个内容及其丰富的研究领域,为当前生物科学领域的热点内容之一。“目前已知的RNA修饰有100多种,其中m
“过去的研究只考虑序列信息,预测的准确率是80%。序列信息是生物信息里最重要的,这点我们不否认,但还有其他信息也是有价值的。”孟佳博士说。
在RNA修饰领域,西浦是第一个应用35种组学信息进行预测的科研团队。“通过该方法将预测准确性提升到90%,这是一个比较大的突破。该工作为RNA修饰领域的研究工作提供了更为可靠的参考信息。”
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“最大的难点是如何构建和选择用于机器学习的特征,”论文第一作者之一、博士生魏震(下图右二)介绍道,“这些特征是我们自己构建的。这是研究过程最基础最困难的部分,但也是我们能够取得突破的关键。”
“实现精准预测并了解了基因RNA修饰的位点之后,接下来就能更容易知道哪些酶会参与到这个过程中来,对进一步研究基因的功能、性状及其与人类某些疾病的关系会有一定的价值。”论文第一作者之一、博士生陈鲲淇(下图右三)补充道。
发表于《核酸研究》上的这篇论文有4位共同第一作者,他们均为西浦生物科学系学生,
早在2012年,
扬子晚报/扬眼记者 顾秋萍 通讯员:石露芸 陈炳宇